Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms