Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snapc3Q9D2C9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snapc3Q9D2C9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms