Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap5-3Q9D226 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms