Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q4

Dpm3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpm3Q9D1Q4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Dpm3Q9D1Q4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dpm3Q9D1Q4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms