Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms