Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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