Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Ndc80Q9D0F1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndc80Q9D0F1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndc80Q9D0F1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndc80Q9D0F1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ndc80Q9D0F1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ndc80Q9D0F1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ndc80Q9D0F1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ndc80Q9D0F1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ndc80Q9D0F1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ndc80Q9D0F1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ndc80Q9D0F1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ndc80Q9D0F1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ndc80Q9D0F1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ndc80Q9D0F1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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