Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms