Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mms19Q9D071 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms