Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms