Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms