Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Sgo1Q9CXH7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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