Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Xrcc3Q9CXE6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Xrcc3Q9CXE6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Xrcc3Q9CXE6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Xrcc3Q9CXE6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Xrcc3Q9CXE6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Xrcc3Q9CXE6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Xrcc3Q9CXE6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Xrcc3Q9CXE6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Xrcc3Q9CXE6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Xrcc3Q9CXE6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Xrcc3Q9CXE6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Xrcc3Q9CXE6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Xrcc3Q9CXE6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Xrcc3Q9CXE6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Xrcc3Q9CXE6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Xrcc3Q9CXE6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Xrcc3Q9CXE6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Xrcc3Q9CXE6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Xrcc3Q9CXE6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Xrcc3Q9CXE6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Xrcc3Q9CXE6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Xrcc3Q9CXE6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms