Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms