Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms