Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms