Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms