Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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