Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prps2Q9CS42 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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