Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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Rab5aQ9CQD1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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