Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQC3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms