Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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