Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms