Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms