Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms