Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms