Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SncaipQ99ME3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms