Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Clcc1Q99LI2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clcc1Q99LI2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Clcc1Q99LI2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clcc1Q99LI2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcc1Q99LI2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcc1Q99LI2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcc1Q99LI2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcc1Q99LI2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcc1Q99LI2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcc1Q99LI2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcc1Q99LI2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcc1Q99LI2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcc1Q99LI2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clcc1Q99LI2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Clcc1Q99LI2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clcc1Q99LI2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clcc1Q99LI2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Clcc1Q99LI2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clcc1Q99LI2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clcc1Q99LI2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clcc1Q99LI2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms