Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms