Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99KU6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99KU6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99KU6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99KU6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99KU6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99KU6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99KU6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99KU6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99KU6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99KU6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99KU6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99KU6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99KU6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99KU6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99KU6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99KU6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99KU6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q99KU6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q99KU6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q99KU6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q99KU6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q99KU6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Q99KU6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99KU6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99KU6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms