Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms