Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms