Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms