Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms