Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms