Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thumpd1Q99J36 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thumpd1Q99J36 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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