Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms