Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbox1Q924Y0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbox1Q924Y0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms