Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csmd1Q923L3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms