Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms