Protein–RNA interactions for Protein: Q922D8

Mthfd1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd1Q922D8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mthfd1Q922D8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms