Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rhbdd2Q8VEK2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rhbdd2Q8VEK2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rhbdd2Q8VEK2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rhbdd2Q8VEK2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms