Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TgdsQ8VDR7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TgdsQ8VDR7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TgdsQ8VDR7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TgdsQ8VDR7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TgdsQ8VDR7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TgdsQ8VDR7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TgdsQ8VDR7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TgdsQ8VDR7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TgdsQ8VDR7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TgdsQ8VDR7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TgdsQ8VDR7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms