Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Uhrf1Q8VDF2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Uhrf1Q8VDF2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Uhrf1Q8VDF2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Uhrf1Q8VDF2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Uhrf1Q8VDF2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Uhrf1Q8VDF2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Uhrf1Q8VDF2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Uhrf1Q8VDF2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Uhrf1Q8VDF2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Uhrf1Q8VDF2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Uhrf1Q8VDF2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Uhrf1Q8VDF2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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