Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam20bQ8VCS3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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