Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmx1Q8VBT0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmx1Q8VBT0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms