Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ClmpQ8R373 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms