Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sf3b4Q8QZY9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms