Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkl1Q8K4J6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkl1Q8K4J6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms