Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccm2Q8K2Y9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms